Die Serovare von Salmonellen werden wesentlich anhand der Struktur der O-Seitenketten des LPS eingeteilt. Dazu verwendet man Antiseren, die für bestimmte Seitenketten spezifisch sind.

Eine Differenzierung der O-Seitenketten allein reicht nicht aus, um alle Variationen der Salmonellen zu erfassen. Hierzu werden die Flagellen der Bakterien herangezogen, welche man als H-Antigene bezeichnet. Diese unterliegen einer Phasenvariation, d.h. ein Salmonellenstamm kann üblicherweise zwei verschiedene Flagellen produzieren.

Die Umschaltung zwischen den Phasen erfolgt auf DNS-Ebene. In der sog. H₂-Phase wird das Gen für diesen Flagellentyp abgelesen und das entsprechende Protein produziert. Auf der gleichen mRNS ist aber ein weiteres Protein kodiert, ein Repressor für das H₁-Gen, welcher die Bildung dieser mRNS unterdrückt. Umgeschaltet wird dadurch, dass der vor dem H₂-Gen liegende Promoter seine Richtung ändern kann, weswegen es eine Position gibt, in der das Gen nicht transkribiert werden kann. Da dann auch der Repressor nicht produziert wird, wird das H₁-Gen abgelesen und das entsprechende Flagellum produziert.

Salmonellen - Zwei Verlaufsformen

Es müssen die häufigere enteritische Verlaufsform und die systemische, zyklische Allgemeininfektion unterschieden werden. Bei den enteritischen Formen bleibt der Erreger normalerweise auf den Darm beschränkt, entsprechend steht die Diarrhoe als Symptom im Verdergrund. Bei der systemischen Verlaufsform wird der Erreger zwar auch oral aufgenommen und vermehrt sich im Darm, verläßt diesen aber alsbald und ver,ehrt sich systemisch. Deshalb benötigt man zur Diagnostik einer Salmonellendiarrhoe Stuhl, für die systemische Infektion Blut für eine Blutkultur.